CDMO公司目的基因插入酵母菌株实验步骤

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CDMO公司目的基因插入酵母菌株实验步骤


 一、感受态制备
  1)接种酵母受体菌单菌落于YPD 平板,30℃培养2 天;
  2)挑取平板上的单菌落接种于10 ml YPD 液体培养基中,30℃摇床震荡过夜;
  3)过夜培养后按1%左右的接种量接种到100 ml YPD 培养基中震荡培养至 OD 值1.2——1.5;
  4)4℃,5000 rpm 离心5 min 收集沉淀菌体,用100 ml 预冷无菌水重悬菌体;
  5)4℃,5000 rpm 离心10 min 收集沉淀菌体,用 100 ml 预冷无菌水重悬菌体;
  6)再次4℃,5000 rpm 离心 10 min 收集沉淀菌体,用 100 ml 预冷无菌水重悬菌体;
  7)20 ml,1 mol/L 山梨醇洗涤1 次;
  8)将菌体溶于200 ul,1 mol/L 预冷山梨醇中,不加甘油,-80℃放置几小时,待转化
  二、电转涂板
  1)准备好80 ul 的酵母感受态与线性化的质粒 1-5 ug(冰上预冷15 min)混合,迅速放入0.2 cm 的电击杯中(电击杯冰上预冷灭菌),电击;
  2)电击结束,迅速加入1 ml 山梨醇,涂平板(在摇床上培养1 h 后涂平板也可);
  3)MD 培养基生长3-4 天,ROB 培养基上生长4-5 天后,鉴定。
  CDMO公司电击注意事项:
  1)线性化质粒的含量在1-5 ug,纯度越高越好,量要有保证,很多人找不到阳性转化子可以考虑是否是这个因素造成;
  2)感受态菌液收集,确定OD 值在 1.2-1.5 之间,可以稀释不同倍数,判断是否是线性关系,菌液浑浊单OD 值不高,可能是OD 稀释倍数不够;
  3)感受态保存,感受态制备但其他还没处理好,冰上放置的时间对转化效率也会有影响,因此还是那个原则:现做现用;且分装成每次够用的量,一旦拿出就不在放回,也避免每次吸取造成污染;
  4)电击杯清洗,先洗净吹干,浸泡在75%乙醇中,使用前超净台紫外灭菌,重复使用对实验也会有一定影响;
  5)电击参数,电压及电击时间可以摸索,适当增加电压或延长电击时间,电击过程冰上操作
  三、挑单克隆
  Mut+ 和Muts 表型的判断
  待转化子在平板上生长一段时间后,进行Mut+ 和Muts 的筛选。挑取单克隆,在MM 及MD 培养基上划线或点(先在MM 平板上点,再在MD 平板上点,一个克隆换一次牙签),30℃培养2 天。观察,在MD 培养基上生长而在MM 培养基上不生长或长的很小即为Muts 表型,其余为Mut+ 表型。
  四、PCR鉴定重组子的方法
  模板的处理
  1.平板上的菌落长到肉眼可见时(约12 小时);
  2.将除了模板之外的其它PCR 反应液的组分准备好,并分装。引物最好使用Kit 中己有的检测专用的引物,或者一条使用载体上的引物,一条使用基因的特异性引物(这样做可以鉴定非定向克隆的方向);
  3.用灭菌的牙签挑取菌落,在PCR管中涮以下,放入一个灭菌的1.5 毫升离心管,对PCR 管和1.5 毫升离心管编号;
  4.PCR扩增,1% agarose 电泳。
  毕酵母基因组提取方法
  1.接种重组和空质粒转化子于5 ml YPDZ培养基,GS115 菌于YPD 培养基作对照,30℃,培养16——18 小时。
  2.室温下,1500 g离心5-10 min 收集茵体。
  3.100 ul TE (pH 7.0)重悬,加入 300 ul EDTA (pH 8.0) 0.07M Tris -HC,3 u蔬基乙醇,l ul Lyticase ,37℃水浴30 min。
  4.10000 g离心5——10 min,取沉淀,加90 ul TE 重悬。
  5.200 ul 饱和酚,200 ul氯仿,混匀,离心30 s ,取上层水相。
  6.加入两倍体积无水乙醇以及1/10 体积的NaAC,-20℃放置30 min;
  7.10000 g离心20 min,弃上清;75%乙醇漂洗沉淀一次,
  8.干燥后,加入15 ul的TE或H20溶解,-20℃备用。

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